上海辰山植物园 English
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>课题组长
 | 课题组长：赵清，博士，研究员 通讯地址：上海市松江区辰花路3888号，上海辰山植物园科研中心 （201602） 联系电话：021-37792288 |
赵清，2013年6月获博士学位（天津大学及英国John Innes Centre联合培养）。从2013年6月到2018年2月，先后在John Innes Centre，中国科学院上海生命科学研究院从事博士后研究。2018年2月到上海辰山植物园(中国科学院分子植物科学卓越创新中心辰山科学研究中心)工作，先后任科研助理，青年课题组长（Junior PI），课题组长（PI）。曾获中国植生协会青年优秀论文奖，“赛诺菲—中科院上海生命科学研究院（SANOFI-SIBS）优秀青年学者奖；入选上海市青年拔尖人才（2020年），中科院青促会会员（2019年），中国植生学会代谢专委会委员（2019年）。研究方向集中于黄芩属及相关物种比较基因组学，药用成分代谢途径解析，调控机制及这些代谢物在相关物种中的进化机制，也涉及活性分子促进健康机制的研究。
>研究领域
黄芩属（及相关物种）植物代谢生物学 ，目前开展的方向有：
1、黄芩属植物基因组及代谢组学；
2、黄芩中黄酮成分的合成途径解析及调控机制研究；
3、植物生物技术及植物底盘的合成生物学
> 科研项目
1. 上海市绿化和市容管理局辰山专项；黄芩属植物类黄酮代谢产物分析及代谢途径解析（G172402），2017.01-2019.12；
2. 上海市绿化和市容管理局辰山专项；药用植物黄芩中重要黄酮合成转录调控机制的研究（G182401），2018.01-2020.12；
3. 自然科学基金青年项目：黄芩中黄芩素、汉黄芩素合成途径中黄酮羟化酶的研究，31700268，2018年1月-2020年12月；
4. 自然科学基金面上项目：黄芩中甲氧基黄酮合成途径中氧位甲基转移酶基因家族的研究，3187011384，2019年1月-2022年12月；
5. 科技部国家重点研发计划课题：常用中药活性成分的合成生物学研究-黄芩素等黄酮的合成生物学制备体系研建，2018YFC1706202，2019 年1月-2021 年 12 月；
6. 中科院青年创新促进会项目：2019年1月-2022年12月；
7. 上海市青年拔尖人才项目：2020年1月-2022年12月；
8. 上海市自然科学基金原创探索项目：2022年4月-2025年4月。
> 重要成果
代表论文（#第一作者*通讯作者）
科研论文
1. Liu, J*. Zhao Y.-X*. et al. Zhao, Q#. (2024) Production of species-specific anthocyanins through an inducible system in plant hairy roots. Metabolic Engineering. 81: 182-196.
2. Pei, T.-L, Zhu, S.-M. et al Cui, M.-Y#, Zhao, Q#. (2023) Gap-free genome assembly and CYP450 gene family analysis reveal the biosynthesis of anthocyanins in Scutellaria baicalensis. Horticulture Research. 10(12): uhad235
3. Fang, Y.-M, et al Zhao, Q#. (2023) SbMYB3 transcription factor promotes root-specific flavone biosynthesis in Scutellaria baicalensis. Horticulture Research. 10(2): uhac266
4. Zheng, M, Fang, Y#, Zhao, Q#. (2023). Comparative analysis of flavones from six commonly used Scutellaria species. Medicinal Plant Biology 2:12
5. Cui, M.-Y, Lu, A.-R, Li, J.-X, Liu, J, Fang, Y.-M, Pei, T.-L, Zhong, X, Wei, Y.-K, Kong, Y, Qiu, W.-Q, Hu, Y.-H, Yang, J, Chen, X.-Y, Martin, C and Zhao, Q#. (2022) Two types of O-methyltransferase are involved in biosynthesis of anticancer methoxylated 4′-deoxyflavones in Scutellaria baicalensis Georgi. Plant Biotechnology Journal. 20: 129-142.
6. Qian et al. Zhao Q#, Cai M-H#. (2022). De novo production of plant 4′-deoxyflavones baicalein and oroxylin A from ethanol in crabtree-negative yeast. ACS Synthetic Biology. 11 (4): 1600-1612.
7. Pei, T.-L, et al Zhao, Q#. (2022) Characterization of UDP-glycosyltransferase family members reveals how major flavonoid glycoside accumulates in the roots of Scutellaria baicalensis. BMC Genomics 23: 169.
8. Zhao, Q*. Yang, J* Cui M-Y et al. Martin, C# (2019). The reference genome sequence of Scutellaria baicalensis reveals how wogonin biosynthesis evolved. Molecular Plant. 12 (7): 935-950.
9. Zhao, Q*. Cui, M-Y*. Levsh, O. Yang D-F. Liu, J. Li, J. Hill, L. Yang, L. Hu, Y. Weng, J-K. Chen, X-Y. Martin, C# (2018) Two CYP82D enzymes function as flavone hydroxylases in the biosynthesis of root-specific 4′-deoxyflavones in Scutellaria baicelensis. Molecular Plant. 11(1): 135-148.
10. Zhao Q, Zhang Y, Wang G, Hill L, Weng J-K, Chen X-Y, Xue H, Martin C# (2016) A specialized flavone biosynthetic pathway has evolved in the medicinal plant, Scutellariabaicalensis. Science Advances. 2, e1501780.
综述
1. Pei, T.-L, et al Zhao, Q#. (2022) Specific Flavonoids and Their Biosynthetic Pathway in Scutellaria baicalensis. Frontiers in Plant Science. 13:866282.
2. 郑敏敏、柳洁、赵清 (2023)；药用植物黄芩的生物学研究进展及展望 ，生物技术通讯 （特邀综述）39(2): 10-23
3. 方誉民，崔孟颖，柳洁，裴天林，魏宇昆，赵清*. 黄芩属植物黄酮生物合成研究进展. 中国中药杂志, 2020, 45(20): 4819-4826.
4. Zhao Q, Chen X-Y# (2016) Development: A new function of plant trichomes. Nature Plants. 2(7).
5. 崔孟颖,柳洁,杨蕾,Cathie Martin,陈晓亚,赵清#. 黄芩,由古籍里走进现代生活的药用植物；世界科学技术-中医药现代化18（11）1921-1928.
6. Zhao Q, Chen X-Y, Martin C# (2016). Scutellaria baicalensis, the golden herb from the garden of Chinese medicinal plants. Science Bulletin. 61(18):1391–1398
专利
1. 一种与黄芩中黄酮合成物相关的基因序列及应用，专利号201710444685.2；
2. 黄芩中花青素转录调控因子SbMYB75和SBDEL的基因克隆载体构建及其应用，专利号201910330805.5；
3. 黄芩黄酮苯丙素和类黄酮O-甲基转移酶基因及其载体构建和应用，专利号：201910330809.3；
> 研究组成员
 | 科学顾问：Cathie Martin，博士，研究员，教授，英国皇家学会会员（FRS） |
Cathie Martin，英国John Innes Centre研究员，从2016年4月开始，在上海辰山植物研究中心兼职。迄今为止，共有7个专利，发表了200余篇SCI期刊论文，参与编写40本书和会议论文集，所发表的作品共有近两万次引用。致力于植物细胞分化及植物次生代谢生物学领域的研究，并且首次发现调控细胞外形的基因，研究兴趣涵盖了整个植物生物学，包括从植物基础研究到技术的应用。
> 研究助理（以姓氏拼音为序）
 | 崔孟颖 科研助理 电话：021-37792288 |  | 柳洁 科研助理 电话：021-37792288 |
 | 方誉民 科研助理 电话：021-37792288 邮箱：fangyumin2014@sina.com |  | 裴天林 博士 科研助理 电话：021-37792288 邮箱：tianlinpei@163.com |
