上海辰山植物园 English
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> 课题组长
 | 研究组长： 陈晓亚 ，博士，研究员，院士 通讯地址：上海市松江区辰花路3888号，上海辰山植物园科研中心 （201602） 联系电话：021-54924033，021-67657815 电子邮件： xychen@sibs.ac.cn |
陈晓亚，博士、研究员。中国科学院院士（2005），发展中国家科学院院士（2008），现任中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所研究员，中国植物生理学与分子生物学会理事长、中国农学会副会长。从事植物次生代谢和棉花生物学研究，早期曾从事植物分类学研究。系统研究青蒿、丹参等药用植物中萜类生物合成途径；克隆鉴定了棉酚途径一系列酶和调控因子基因。研究棉纤维发育机制，分离鉴定了棉纤维伸长关键调控因子和细胞壁蛋白基因。分析植物次生代谢在植物-昆虫互作中的作用；以棉铃虫为模式，发展了一种植物介导的RNA干扰抗虫技术，在植物生物技术相关研究领域取得重要进展。
迄今已发表论文100余篇（包括Nature Biotechnology, Nature Chemical Biology, Plant Cell, Molecular Plant, PNAS, Science Advances等刊物），申请专利十余项。主持或参加国家重大专项、中科院先导项目、STS项目、国家自然科学基金项目等。1999年获国家杰出青年科学基金，2008年获何梁何利科学技术进步奖，2018年获上海市自然科学一等奖。
> 研究方向
从事植物次生代谢及药用植物研究，主要工作包括：药用植物次生代谢产物的生物合成及调控；唇形科鼠尾草属药用植物的多样性和系统进化；活性次生代谢产物的开发利用。
> 研究内容
（1）植物特殊代谢产物的生物合成及调控：鼠尾草属（Salvia）药用植物研究，通过转录组数据库构建和化学分析，分析有关活性成分的生物合成及调控，包括活性成分生物合成关键酶的克隆以及调控机制；
（2）植物营养成分及维生素生物合成研究，解析泛醌生物合成途径，分析植物异戊二烯途径对相关维生素生物合成的调控。
> 发表文章
1. Xu* JJ, Hu M, Yang L, Chen XY. How plants synthesize coenzyme Q. Plant Communications. 2022, 3(4):100341.
2. Li CY†, Yang L†, Liu Y, Xu ZG, Gao J, Huang YB, Xu JJ, Fan H, Kong Y, Wei YK, Hu WL, Wang LJ, Zhao Q, Hu YH, Zhang YJ, Martin C, Chen XY*. The Sage Genome Provides Insight into the Evolutionary Dynamics of Diterpene Biosynthesis Gene Cluster in Plants. Cell Reports. 2022, 40(7):111236.
3. Song JJ†, Fang X†, Li CY, Jiang Y, Li JX, Wu S, Guo J, Liu Y, Fan H, Huang YB, Wei YK, Kong Y, Zhao Q, Xu JJ, Hu YH, Chen XY, Yang L*. A 2-oxoglutarate dependent dioxygenase converts dihydrofuran to furan in Salvia diterpenoids. Plant Physiology. 2022, 188(3):1496-1506.
4. Xu JJ†, Zhang XF†, Jiang Y, Fan H, Li JX, Li CY, Zhao Q, Yang L, Hu YH, Martin C, Chen XY*. A unique flavoenzyme operates in ubiquinone biosynthesis in photosynthesis-related eukaryotes. Science Advances. 2021. DOI: 10.1126/sciadv.abl3594.
5. Fan H, Liu Y, Li CY, Jiang Y, Song JJ, Yang L, Zhao Q, Hu YH, Chen XY, Xu JJ*. Engineering high Coenzyme Q10 tomato. Metabolic Engineering. 2021, 68:86-93.
6. Huang JQ, Li DM, Tian X, Lin JL, Yang L, Xu JJ, Fang X*. Side Products of Recombinant Amorpha-4,11-diene Synthase and Their Effect on Microbial Artemisinin Production. Agricultural and Food Chemistry. 2021, 69(7):2168–2178.
7. Xu JJ, Fang X, Li CY, Yang L, Chen XY*. General and specialized tyrosine metabolism pathway in plants. aBIOTECH. 2019, DOI: 10.1007/s42994-019-00006-w.
8. Cao JF, Zhao B, Huang CC, Chen ZW, Zhao T, Liu HR, Hu GJ, Shangguan XX, Shan CM, Wang LJ, Zhang TZ, Jonathan FW, Guan XY*, Chen XY*. The miR319-Targeted GhTCP4 Promotes the Transition from Cell Elongation to Wall Thickening in Cotton Fiber. Molecular Plant. 2020, 13(7):1063-1077
9. Chen YN, Lu QY, Li DM, Li YY, Pu XX, Li BT, Tang XH, Tang HY, Liu S, Yang L, Zhang Y, Di YT, Fang X*, Hao XJ*. Three new diterpenoids from Euphorbia peplus. Natural Product Research. 2021, 35(21):3901-3907
10. Chen YN, Ding X, Lu QY, Li DM, Li BT, Liu S, Yang L, Zhang Y, Di YT, Fang X*, Hao XJ*. Macrocyclic Diterpenoids from the seeds of Euphorbia peplus with Potential Activity in Inducing Lysosomal Biogenesis. Bioorganic Chemistry. 2020, 105:104464.
11. Xu JJ, Fang X, Li CY, Zhao Q, Cathie M, Chen XY, Lei Yang*. Characterization of Arabidopsis thaliana Hydroxyphenylpyruvate Reductases in the Tyrosine Conversion Pathway. Frontiers in Plant Science. 2018, 9:1305.
12. Zhao B, Cao JF, Hu GJ, Chen ZW, Wang LY, Shangguan XX, Wang LJ, Mao YB, Zhang TZ, Jonathan FW, Chen XY*. Core cis-element variation confers subgenome-biased expression of a transcription factor that functions in cotton fiber elongation. New Phytologist. 2018, 218(3):1061-1075.
13. Tian X, Ruan JX, Huang JQ, Yang CQ, Fang X, Chen ZW, Hong H, Wang LJ, Mao YB, Lu S, Zhang TZ, Chen XY*. Characterization of Gossypol Biosynthetic Pathway. PNAS. 2018, 115(23):E5410-E5418.
14. Fang X, Li CY, Yang Y, Cui MY, Chen XY, Yang L*. Identification of a novel (-)-5-epieremophilene synthase from Salvia miltiorrhiza via transcriptome mining. Frontiers in Plant Science. 2017, 8:627.
15. Mao YB, Liu YQ, Chen DY, Chen FY, Fang X, Hong GJ, Wang J, Wang JW, Chen XY*. Jasmonate response decay and defense metabolite accumulation contributes to age-regulated dynamics of plant insect resistance. Nature Communications. 2017, 8:13925.
16. Chao LM, Liu YQ, Chen DY, Xue XY, Mao YB, Chen XY*. Arabidopsis Transcription Factors SPL1 and SPL12 Confer Plant Thermotolerance at Reproductive Stage. Molecular Plant. 2017, 10:735-748.
17. Fang X, Li JX, Huang JQ, Xiao YL, Zhang P, Chen XY*. Systematic identification of functional residues of Artemisia annua amorpha-4,11-diene synthase. Biochemical Journal. 2017, 474:2191-2202.
18. Zhao Q, Chen XY*. Development: A new function of plant trichomes. Nature Plants. 2016, 2(7).
19. Yang L, Yang CQ, Li CY, Zhao Q, Liu L, Fang X, Chen XY*. Recent advances in biosynthesis of bioactive compounds in traditional Chinese medicinal plants. Science Bulletin. 2016, 61(1):3-17.
20. 朱小洁，周翔宇，范航，高喜凤，杨蕾*. 9种唇形科芳香植物挥发性萜类成分的比较分析. 植物研究. 2020, 40(5):696-705.
> 专利授权
1. 杨蕾, 陈晓亚, 许晶晶, 李辰意, 宋娇娇, 范航. 发明专利丹参酮IIA合酶的基因序列及应用 CN113005130B
2. 许晶晶, 杨蕾, 范航, 陈晓亚, 李辰意. 辅酶Q合成途径苯环6位羟化酶及其应用 CN113151368B
3. 许晶晶, 范航, 杨蕾, 陈晓亚. 一种可提高番茄中辅酶Q10含量的联合载体及其构建方法和应用 CN112280797B
4. 孔羽, 魏宇昆, 杨蕾.一种中草药祛痘修复组合物及其制备方法 CN105380840B
> 研究组成员
> 研究助理
 | 杨 蕾 研究员，博士 电 话：021-37792288*913 邮 箱： leiyang@cemps.ac.cn |  | 许晶晶 副研究员，博士 电 话：021-37792288*913 邮 箱：jjxu02@cemps.ac.cn |
 | 刘羽心 助理研究员，硕士 电话：021-37792288*913 邮箱：liuyx1009@126.com |
> 在读研究生
刘燕（2020）、胡玫（2020）、朱慧（2020）、熊殊艺（2021）、任襄襄（2021）、王竹新（2021）、曲芊蕊（2022）
> 出站博士后
杨蕾（2010）、邢世海（2012）、赵清（2014）、许晶晶（2015）、范航（2019）
> 研究生(已毕业)
王川（2009）、景鹏飞（2010）、陈蓓（2010）、成海宁（2011）、周晓希（2011）、刘灵（2012）、崔孟颖（2013）、朱小洁（2017）、宋娇娇（2018）、蒋妍（2018）
