研究队伍

茄科进化与代谢研究组

> 课题组长

　　研究组长：陈可，博士，青年研究员

　　通讯地址：上海市松江区辰花路3888号，中国科学院上海辰山植物科学研究中心（201602）

　　电话：021-37792288-907

　　邮箱：chenke@csnbgsh.cn

　　陈可，2016年3月获得细胞与分子生物学博士学位（法国国家科学院植物细胞分子生物学研究所，斯特拉斯堡大学，法国；Institut de biologie moléculaire des plantes , Centre National de la Recherche Scientifique, Université de Strasbourg，France ）。2016年至2021年在上海交通大学系统生物医学研究院任助理研究员。2021年6月加入上海辰山植物园（中国科学院上海辰山植物科学研究中心），任茄科进化与代谢组青年课题组长（Junior PI）。主持国家自然科学基金，上海市绿容绿化管理局专项基金，上海市“扬帆计划”人才计划，上海市“青年英才”计划，上海交大医工交叉基金等。研究方向为茄科功能基因研究，比较基因组学，代谢组学等。

> 研究领域

　　茄科植物功能基因解析，生长状态研究，代谢组学，单细胞组学等多组学数据信息深度挖掘及细胞工程研究

>研究内容

　　1）可塑性基因家族对茄科植物生长性状调控

　　2）茄科植物cT-DNA序列及功能研究

　　3）植物生物工程技术及功能基因相关的小分子代谢调控

> 科研成果

学术论文

　　1. Ke Chen#, Peter Zhurbenko#, Lavrentii Danilov, Tatiana Matveeva and Léon Otten*. Conservation of an Agrobacterium cT-DNA Insert in Camellia Section Thea Reveals the Ancient Origin of Tea Plants from a Genetically Modified Ancestor, Frontiers in Plant Science, 2022, 6;13:997762.

　　2. Jiawei Zou, Fulan Deng, Miaochen Wang, Zhen Zhang, Zheqi Liu, Xiaobin Zhang, Rong Hua, Ke Chen*, Xin Zou*, Jie Hao*, scCODE:an R package for data-specific differentially expressed gene detection on single-cell RNA-sequencing data, Brief Bioinform, 2022, 23;bbac180.

　　3. Léon Otten, T‑DNA regions from 350 Agrobacterium genomes: maps and phylogeny, Plant Molecular Biology, 2021, 106:239–258.

　　4. Tatiana V Matveeva, Léon Otten*. Opine biosynthesis in naturally transgenic plants: Genes and products." Phytochemistry, 2021, 189: 112813.

　　5. Xin Zou#, Ke Chen#, Jiawei Zou, Peiyi Han, Jie Hao, Zeguang Han, The single-cell RNA-seq data analysis on the receptor ACE2 expression reveals the potential risk of different human organs vulnerable to Wuhan 2019-nCoV infection, Frontiers of medicine, 2020, 14(2):185-192.

　　6. Thomas Potuschak, Javier Palatnik, Carla Schommer, Nicolas Sierro, Nikolai V Ivanov, Yerim Kwon, Pascal Genschik, Jean-Michel Davière, Léon Otten*, Inhibition of Arabidopsis thaliana CIN-like TCP transcription factors by Agrobacterium T-DNA-encoded 6B proteins, Plant Journal, 2020, 101(6):1303-1317.

　　7. Tatiana V Matveeva, Léon Otten*, Widespread occurrence of natural genetic transformation of plants by Agrobacterium, Plant Mol Biol, 2019,101(4-5):415-437.

　　8. Léon Otten*, The Agrobacterium Phenotypic Plasticity (Plast) Genes, Curr Top Microbiol Immunol, 2018, 418:375-419.

　　9. Ke Chen, François Dorlhac de Borne, Nicolas Sierro, Nikolai V. Ivanov, Malek Alouia, Sandrine Koechler, Léon Otten*, Organization of the TC and TE cT-DNA regions in Nicotiana otophora and functional analysis of three diverged TE-6b genes, Plant Journal, 2018, 94(2):274-287.

发明专利

　　1. 一种植物生长基因与发育阶段和细胞类型关系判定方法。202211166112.5。

　　2. 一种植物生长发育动态监控的方法。202211200145.7。

　　3. 抑制新型冠状病毒SARS-CoV-2感染宿主细胞的多肽及其应用。CN202010450107.1。

　　4. 一种基于核磁共振谱洛伦兹曲线数学性质的小波去噪方法。CN201810953635.1。

　　5. 一种独立计算具有90度相位差的洛伦兹曲线参数的方法。CN201810906851.0。

> 研究组成员

>科学顾问