主要工作包括： 
1) 植物次生代谢研究 
植物萜类生物合成及调控：棉酚、青蒿素生物合成关键酶基因克隆与表达调控，代谢工程等； 
丹参等唇形科植物中的苯丙烷类化合物代谢及调控； 
2)植物-昆虫相互关系研究 
植物次生代谢与抗虫，植物介导的RNA干扰抗虫新技术； 
3) 棉纤维发育调控的分子机制研究 
棉纤维发育调控因子克隆与分析，植物表皮毛发育调控机制。 
研究组网页：http://sippe.ac.cn/xy/

国家“杰出青年基金”获得者 
“何良何利奖”获得者

指导研究生总数为19人，目前在读12人

1982年2月毕业于南京大学生物系，获学士学位 
1985年12月获英国Reading 大学植物学博士学位 
1985-1991年在南京大学生物系任教 
1991-1992年在德国Tuebingen大学植物学系进行访问研究 
1992-1994年在美国Purdue大学做博士后研究 
1994年10月至今在中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所（原中科院上海植物生理研究所）工作 
现任植物生理生态研究所研究员，上海辰山植物科学研究中心主任。 
已在国内外发表论文60余篇（包括Nature Biotechnology, Nature Communications, Plant Cell, Plant Physiology等国际重要刊物），申请专利数项。主持国家重点基础研究发展计划（973）课题、中科院重要方向性项目，国家自然科学基金重点项目等。1999年获国家杰出青年基金资助，2005年入选中国科学院院士，2008年入选发展中国家科学院院士。

1.     Yu ZX, Wang LJ, Zhao B, Shan CM, Zhang YH, Chen DF, Chen XY*. 2014. Progressive Regulation of Sesquiterpene Biosynthesis in Arabidopsis and Patchouli (Pogostemon cablin) by the miR156-Targeted SPL Transcription Factors. Mol. Plant 8(1): 98-110.
2.     Shan CM, Shangguan XX, Zhao B, Zhang XF, Chao LM, Yang CQ, Wang LJ, Zhu HY, Zeng YD, Guo WZ, Zhou BL, Hu GJ, Guan XY, Chen JZ, Wendel JF, Zhang TZ, Chen XY*. 2014. Control of cotton fibre elongation by a homeodomain transcription factor GhHOX3. Nat. Commun. 5:5519 doi: 10.1038/ncomms6519 (2014). 
3.     Xue XY, Zhao B, Chao LM, Chen DY , Cui WR , Mao YB, Wang LJ, Chen XY. 2014. Interaction between Two Timing MicroRNAs Controls Trichome Distribution in Arabidopsis. PLOS Genetics. doi: 10.1371/journal.pgen.1004266
4.     Yang L, Ding GHi, Lin HY, Cheng HN, Kong Y, Wei YK, Fang X, Liu RY, Wang LJ, Chen XY and Yang CQ. 2013. Transcriptome analysis of medicinal plant Salvia miltiorrhiza and identification of genes related to tanshinone biosynthesis. PLOS ONE. 8(11):e80464.
5.     Mao YB, Xue XY, Tao XY, Yang CQ, Wang LJ, Chen XY*. 2013. Cysteine protease enhances plant-mediated bollworm RNA interference. Plant Mol Biol. 83(1-2): 119-29. 
6.     Li JX, Fang X, Zhao Q, Ruan JX, Yang CQ, Wang LJ, Miller DJ, Faraldos JA, Allemann RK, Chen XY*, Zhang P*. 2013. Rational engineering plasticity residues of sesquiterpene synthases from Artemisia annua: product specificity and catalytic efficiency. Biochemical Journal 451(3):417-426. 
7.     Xu B, Gou JY, Li FG, Shangguan XX, Zhao B, Yang CQ, Wang LJ, Yuan S, Liu CJ, Chen XY*. 2013. A Cotton BURP Domain Protein Interacts With α-Expansin and Their Co-Expression Promotes Plant Growth and Fruit Production. Mol. Plant 6 (3): 945-958.
8.     Hong GJ, Xue XY, Mao YB, Wang LJ, Chen XY*. 2012. Arabidopsis MYC2 Interacts with DELLA Proteins in Regulating Sesquiterpene Synthase Gene Expression. Plant Cell 24: 2635–2648.
9.     Tao XY, Xue XY, Huang YP, Chen XY and Mao YB*. 2012. Gossypol-enhanced P450 gene pool contributes to cotton bollworm tolerance to a pyrethroid insecticide. Molecular Ecology 21, 4371–4385.
10.   Yu ZX, Li JX, Yang CQ, Hu WL, Wang LJ, and Chen XY*. 2012. The Jasmonate-Responsive AP2/ERF Transcription Factors AaERF1 and AaERF2 Positively Regulate Artemisinin Biosynthesis in Artemisia annua L. Mol. Plant 5(2): 353-365. 
11.   Zhang T et al. 2015. Sequencing of allotetraploid cotton (Gossypium hirsutum L. acc. TM-1) provides a resource for fiber improvement. Nature Biotechnology 33,531–537.